Создал настройку отчета Исполнение плана.  В фильтре указал: остаток на начало = 0, остаток на конец <0.
Т. е.  сколько еще по плану расходов за период. 
Когда выбираю настройку то ее фильтр не применяется.  Тоже самое с ярлыком. 
Если тот же фильтр задать в самом отчете, то он фильтрует корректно.
Возможно,  распространяется на другие отчеты. 
Версия 6.4.2.